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豚丹毒原因菌の全遺伝情報解析の基礎研究 : Erysipelothrix属菌のPCR-Restriction Fragment Length Polymorphism(RFLP)による解析
https://az.repo.nii.ac.jp/records/4442
https://az.repo.nii.ac.jp/records/4442036a0b8c-eb26-4fc0-bca5-dc801f2c822a
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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bull_jau_vol5-6-164.pdf (105.2 kB)
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| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||||||||||||||
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| 公開日 | 2002-01-01 | |||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||
| タイトル | 豚丹毒原因菌の全遺伝情報解析の基礎研究 : Erysipelothrix属菌のPCR-Restriction Fragment Length Polymorphism(RFLP)による解析 | |||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||
| タイトル | Basic genome analysis of Swine erysipelas : Analysis of the genus Erysipelothrix by PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) | |||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||||||||||||||
| ページ属性 | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||
| 内容記述 | P(論文) | |||||||||||||||||
| 記事種別 | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||
| 内容記述 | 特集 | |||||||||||||||||
| Type | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||
| 内容記述 | FEATURE ARTICLES | |||||||||||||||||
| 著者 |
木内, 明男
× 木内, 明男
× 鈴木, 嘉彦
× 志村, 純子
× Kiuchi, Akio
× Suzuki, Yoshihiko
× Shimura, Junko
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| 著者ID | ||||||||||||||||||
| 000044 | ||||||||||||||||||
| 著者ID | ||||||||||||||||||
| - | ||||||||||||||||||
| 著者ID | ||||||||||||||||||
| - | ||||||||||||||||||
| Author ID | ||||||||||||||||||
| 000044 | ||||||||||||||||||
| Author ID | ||||||||||||||||||
| - | ||||||||||||||||||
| Author ID | ||||||||||||||||||
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| 所属機関 | ||||||||||||||||||
| 麻布大学大学院獣医学研究科 | ||||||||||||||||||
| 所属機関 | ||||||||||||||||||
| 麻布大学大学院獣医学研究科 | ||||||||||||||||||
| 所属機関 | ||||||||||||||||||
| 麻布大学大学院獣医学研究科 | ||||||||||||||||||
| Institution or Company | ||||||||||||||||||
| Graduate School of Veterinary Science, Azabu University | ||||||||||||||||||
| Institution or Company | ||||||||||||||||||
| Graduate School of Veterinary Science, Azabu University | ||||||||||||||||||
| Institution or Company | ||||||||||||||||||
| Graduate School of Veterinary Science, Azabu University | ||||||||||||||||||
| 抄録 | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||
| 内容記述 | Erysipelothrix属は,豚丹毒菌E.rhusiopathiaeと豚箱抗菌E.tonsillarumに分類され,未命名菌種の存在も知られている。PCRプライマーは,Erysipelothrix属を特異的に増幅する塩基配列を16SrRNADATAbaseより設計したE.rhusiopathiae 15血清型とN型,E.tonsillarum 7血清型および未命名菌種2菌種を用いた。PCR反応は,94C5分間に続いて94C30秒間,60C30秒間,72C30秒間を25サイクル後,72C7分間を追加した。PCR産物をE.rhusiopathiaeとE.tonsillarumの基準株および参照株の16S rRNA塩基配列の解析結果に基づいて制限酵素Dde IあるいはEco 811で処理し,切断パターンを解析した。 1. 選定したプライマーにより,417塩基対が特異的に増幅し,対照としたグラム陽性菌8菌属9菌種およびグラム陰性8菌属8菌種とは反応しなかった。 2. 16SrRNA遺伝子の約1,500塩基の解析から,E.rhusiopathiaeとE.tonsillarumの基準株は,3塩基の置換が確認された。一方,未命名菌種のうち「血清型13」とE.rhusiopathiae基準株とのホモロジーは,99.9%であった。 3. RFLPの成績は,報告されているDNA-DNA相同性の成績と一致した。また,未命名菌種「血清型13および18」は,E.rhusiopathiaeのカテゴリーに分類された。 以上の結果により,PCR-RELP法は,Erysipelothrix属菌株を迅速・簡易な手技で検出可能で,種の同定にも利用できる有用な方法である。 |
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| Abstract | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||
| 内容記述 | Basic genome analysis of Swine erysipelas: Analysis of the genus Erysipelothrix by PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) Genus Erysipelothrix has been divided into two species, Erysipelothrix rhusiopathiae and Erysipelothrix tonsillarum. There are another unclassified strains. We made specific primer pairs for the detection of Genus Erysipelothrix based on the 16S rRNA (DNA) DATAbase. It got a specific 417 base pairs PCR products only for the genus Erysipelothrix. Other bacterial strains concerning swine infectious diseases didn't react later on. Based on the analysis of 16SrDNA sequences (1500bp), 3 nucleotides mutated Erysipelothrix rhusiopathiae and Erysipelothrix tonsillarum reference strains each other. On the other hand, a homology with "the serotype 13" and the E. rhusiopathiae type strain in the unclassified bacterial strain was 99.9%. The results of RFLP have been corresponded to the reported DNA-DNA homology. And, an unclassified bacterial strain "serotype 13 and 18" was classified in the category of E. rhusiopathiae. Using these PCR-RELP method, it is detectable the Erysipelothrix strain rapidly, and it is the useful procedure which the identification of the species can utilize again, too. |
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| 書誌情報 |
麻布大学雑誌 en : Journal of Azabu University 巻 5/6, p. 164-165, 発行日 2003-03-31 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||
| 出版者 | 麻布大学 | |||||||||||||||||
| Publisher | ||||||||||||||||||
| 出版者 | Azabu University | |||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 1346-5880 | |||||||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||||||
| 収録物識別子 | AA11561468 | |||||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||
| text version | ||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||
| format | ||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||||||
| 内容記述 | application/pdf | |||||||||||||||||
